Pertolzhofen ist eine sogenannte "Expositur". Früher war das eine Bezeichnung für eine nicht-selbstständige Kirchengemeinde, die - rechtlich gesehen - an eine andere Pfarrei angegliedert war. Pertolzhofen war früher an Niedermurach angegliedert. Heute ist das hinfällig, weil Pertolzhofen genauso wie Niedermurach und Teunz eine gemeinsame Seelsorgeeinheit bilden.
Die Expositur Pertolzhofen besteht seit 1917. Sie umfasst ca. 460 Einwohner (davon 440 Katholiken). Sie verteilen sich auf die Ortschaften Pertolzhofen selbst (380 Einwohner), Braunsried (18), Mantlarn (36), Zankendorf (26).
Die Expositurkirche ist der Mutter Gottes (Maria Immaculata) geweiht und wurde 1697-99 erbaut, sie fasst 300 Sitzplätze. In unmittelbarer Nähe zur Expositurkirche steht die im Jahre 1732 erbaute Johannes Nepomuk-Kapelle.